本性光明名覺，無明蓋住名迷，無明愈蓋愈厚，本性愈迷愈深，這樣就失了自在，稱作煩惱。其實無明與煩惱不是二事，無明是說因，煩惱是說果。

煩惱有根本與隨起的分別，若按百法明門論來說，根本煩惱，共有六種，這是應該先知道的。一名貪，就是貪愛五欲六塵，不肯暫捨；二名瞋，就是有不如意的事，便發怒氣，或是憎惡；三名痴，就是昏昏迷迷，不明事理；四名慢，就是自高自大，輕慢他人；五名疑，就是對於實事實理，猶豫不定，似信非信；六名邪見，就是顛倒邪正，謗無因果。

因為這些煩惱，迷住本性，以後起心動念，皆是煩惱來用事，自然多造作惡業，長受苦的果報。