明末憨山德清大師，在〈勅建五臺山大護國聖光寺妙峰登禪師傳〉一文，記載大師與妙峰禪師相識的因緣。
妙峰禪師，明末禪宗僧人，法名福登，俗姓續，是春秋名人續鞠居的後代。二十七歲時，受具足戒。
妙峰禪師，至江南雲遊參學，朝拜南海普陀山，回寧波的路上，染上流行病，差點就斷了命。有一夜，住在旅舍，身體很虛弱，口乾舌燥，很想喝水解渴，茶壺裡卻沒有半滴水。伸手一探，就著盥洗的浴盆，掬起水來喝，覺得甘美無比，瞬間解了渴。
隔天早上，看見浴盆裡的水，混濁又汙穢，覺得很噁心，嘔吐不止。突然領悟︰「飲之甚甘，視之甚濁，淨穢由心耳。」這一盆水，半夜喝來甘甜爽口，早上卻變得污穢混濁，原來水的淨穢，是自己的心識分別啊！想著想著，滿身冒出大汗，病就痊愈了，但是從此全身疥瘡黃腫。
明穆宗隆慶元年冬天，妙峰禪師來到南京。這時無極大師在天界寺宣講《法華經》，憨山大師擔任副講。每日早上起來，都看見淨房（廁所）十分清潔，知道這位淨頭（打掃浴廁的人）絕非泛泛之輩，必是高人。於是在半夜偷偷偵查，看見淨頭拿著燈火，仔細地打掃淨房，清洗籌杖──廁所中用以代紙拭糞之小木、竹片。靠近一看，原來是位黃腫病的僧人，心裏覺得很特別。原來擔任淨頭的僧人，正是妙峰禪師。
過了一段時間，妙峰禪師臥病不起。憨山大師前往客寮探視，禪師全身瘡腫，連手都舉不起來。
大師問他：「能否安心辦道？」
禪師回答︰「都是業障啊！身體的病已經很難受了，還有嘴饞的病，更是難治啊！」
大師問︰「怎麼說呢？」
禪師說︰「每次見到行堂，端著饅頭走過，就恨不得他能放下饅頭。」
憨山大師知道妙峰禪師是有道之人，隔日便帶了一些糕餅瓜果去問候，親手拿給他，禪師吃得很歡喜。憨山大師笑著說︰「您是一位真道人啊！」因此常去探視談話。
妙峰禪師說︰「每次聽無極大師講經，都能心開意解。」在年輕時，妙峰禪師就有如此的妙悟。
