明代蕅益大師，閱讀蓮池大師增補的《自知錄》後，盡焚年少時的闢佛文稿。二十歲，喪父，得聞地藏本願，發出世了生死的心。二十二歲，專心一志念佛，將過往所作的兩千多篇文稿，一焚而盡。二十四歲出家，全力參禪，用功至極，「一切經論，一切公案，無不現前」。二十七歲，遍閱律藏，方知舉世都錯了。二十八歲閉關，病重，以禪功求生淨土。三十歲出關，道友請講律藏，開始著述《毗尼事義集要》，及《梵室偶談》。
三十八歲，因病避居九華山，在佛前「拈得『閱藏、著述』一鬮」，於是安心廣閱藏經，一心著述，發願要「著述開人天眼目，字字皆懸契佛心」。
蕅祖，自年少即立說闢佛，一心歸命三寶後，隨時著述，竭力講演，與有緣眾生結「圓頓種」。〈與胡遠志書〉云：「納長於著述，短於應酬。」著述又宜在晚年，蕅祖〈寄修雅法主〉，引雲棲大師云：「古人著述，多在晚年。」因佛法無量無邊，眾生無窮無盡，古來大德注疏論說，費盡一生精神，且博覽世間出世間的學問，僅有一兩本著作傳世，還免不了讓後賢指摘駁斥，何況是一時之間的口耳著述？「著述，須實從自己胸中流出。」
蕅祖為許多經論作「箋」，原則是「箋釋者，固不必盡殉舊說，亦不必盡廢舊說。但虛其心，體其言外之旨，疏其文字之脈。」這是蕅祖與郭太爵的書信所言。為佛經作箋注釋，不必盡依舊說作解，也不必完全廢棄舊說。只要虛心體會經論的言外旨趣，將文字脈絡疏通就可以了。
蕅祖四十七歲，邁入他的人生最後十年，經多年的解行悟證，已能圓解佛法宗趣，故此後的注疏，多稱性而談，著述之速，令人歎為希有。以下謹就蕅祖有記錄著述時程的注疏，略說於下。
蕅祖四十七歲，在天臺山的石城，完成《周易禪解》。為何要以禪解《周易》？因郭太爵居士向蕅祖請教《周易》，因此為他先解《繫辭傳》、《序卦傳》、《雜卦傳》、《乾、坤文言傳》，再解上經、下經。此書「從辛巳冬至今乙酉夏」，歷經一千二百多日完稿。
蕅祖云：「吾所由解《易》者無他，以禪入儒，誘儒知禪耳。」欲以禪觀深入《周易》至理，以此誘導儒者藉此書而發心修學禪觀。
蕅祖四十九歲，撰《彌陀要解》。因弟子去病居士，久修淨業，希望有一部深得《阿彌陀經》大旨，文辭簡要不繁而明顯的注解，故請蕅祖作解。蕅祖「舉筆于丁亥九月二十有七，脫稿於十月初五，凡九日告成。」
九天完稿的《要解》，蕅祖「願一句一字，咸作資糧。一見一聞，同階不退。信疑皆植道種，讚謗等歸解脫。」全書計一萬多字，願每一字一句，讀者閱後皆能深信切願念佛，廣積三資糧，同證三不退。縱使有人深信，有人起疑，都能培植菩提種，或讚或謗皆得解脫。
蕅祖四十九歲，撰《成唯識論觀心法要》。玄奘大師揉譯的《成唯識論》，是佛祖的傳心要訣，蕅祖自感遺憾為業所障，不能剋證佛祖心要，然而「性相源頭，頗窺一線。誠或諸聖冥加，故亦不敢自祕，聊竭隙明，和盤托出。」對於佛法性相二宗的源頭，窺得一線光明，或許是因佛菩薩的冥冥中加被，故不敢自我秘藏，願竭盡心力和盤托出這一隙之明，以確立唯識觀的道理。
「舉筆於丁亥三月廿五日，脫稿於五月廿五日，閱兩月，述成《觀心法要》十卷。」願若有見聞者，隨喜不退菩提。若信若疑，當來都能成就菩提妙種，同生極樂淨邦。先覲見阿彌陀佛，再還入龍華初會，作彌勒佛的影響眾，盡未來際廣度含識，眾生度盡方證涅槃。
蕅祖五十一歲，在靈峰寺，述《法華會義》。蕅祖感慨，能演《法華》妙旨的智者大師，早已入滅，後世賢哲堅固執著，滋生鬥諍，致使圓融絕待的法門，幾乎演成人我是非的情見。弘揚《法華》者，如築起又高又深的城塹，觀望者，見了更加懷疑畏懼。
蕅祖見此，扼腕痛心，於是作疏介紹，「舉筆於己丑十一月初五日」，剛完成序文，便病臥半月。至十九日，才得以勉強撰述。從早到晚孳孳，手不停寫，眼不停看。到了臘月二十六日，僅完成八卷。過年歇停三日，新春元旦隨及試筆，又經歷一個月總算告成，「足運心力六十八日」，一十六卷的《會義》，運盡六十八天的心力。
蕅祖述《會義》，為誘接初學，得以漸漸悟入《法華》實相，釋迦佛、普賢菩薩、智者大師必能諒察這番苦心。
